1899 Hoffenheim
* Zugänge: Timo Hildebrand (CF Valencia)
* Abgänge: Francisco Copado (SpVgg Unterhaching), Jochen Seitz (Alemannia Aachen)
FC Bayern München
* Zugänge: Landon Donovan (LA Galaxy, auf Leihbasis), Ivica Olic (Hamburger SV, ab Sommer 2009)
* Abgänge: –
Hertha BSC
* Zugänge:
* Abgänge:
Hamburger SV
* Zugänge:
* Abgänge: Ivica Olic (Bayern München, ab Sommer 2009)
Bayer Leverkusen
* Zugänge: Thomas Zdebel (VfL Bochum)
* Abgänge: Stefan Reinartz, Marcel Risse (beide 1. FC Nürnberg), Jens Hegeler (FC Augsburg, verliehen bis 2010)
Borussia Dortmund
* Zugänge:
* Abgänge: Diego Fernando Klimowicz (VfL Bochum), Giovanni Federico (Karlsruher SC, auf Leihbasis)
FC Schalke 04
* Zugänge:
* Abgänge: Markus Heppke (RW Oberhausen). Peter Lövenkrands (Vertrag aufgelöst),Ralf Fährmann (Eintr.Frankfurt ab Sommer 2009)
Werder Bremen
* Zugänge: Alexandros Tziolis (Panathinaikos Athen, ausgeliehen)
* Abgänge: Dennis Diekmeier (1. FC Nürnberg)
VfL Wolfsburg
* Zugänge: Yoshito Okubo (Kobe)
* Abgänge: Vlad Munteanu (Arminia Bielefeld, auf Leihbasis)
VfB Stuttgart
* Zugänge: Timo Gebhart (1860 München)
* Abgänge: Manuel Fischer (ausgeliehen an TuS Koblenz), Pavel Pardo (CF América)
1. FC Köln
* Zugänge:
* Abgänge:
Eintracht Frankfurt
* Zugänge: Leonard Kweuke (DAC Dunajská Streda, ausgeliehen bis Saisonende),Ralf Fährmann (Schalke 04 ab Sommer 2009)
* Abgänge:Aaron Galindo (Club Deportivo Guadalajara)
Hannover 96
* Zugänge:
* Abgänge:
Arminia Bielefeld
* Zugänge: Vlad Munteanu (VfL Wolfsburg, auf Leihbasis), Kevin Kerr (eigene Jugend)
* Abgänge: Stefan Aigner (TSV 1860 München), Siyabonga Nkosi (Maccabi Netanya), Nils Fischer (Wuppertaler SV, auf Leihbasis)
Karlsruher SC
* Zugänge: Giovanni Federico (Borussia Dortmund, auf Leihbasis), Marco Engelhardt (1. FC Nürnberg)
* Abgänge:
Energie Cottbus
* Zugänge: Jan Rajnoch (ausgeliehen von FK Mlada Boleslav), Adi (Austria Kärnten), Nils Petersen (FC Carl Zeiss Jena)
* Abgänge:
VfL Bochum
* Zugänge: Diego Fernando Klimowicz (Borussia Dortmund)
* Abgänge:Danny Fuchs (ausgeliehen an 1. FC Kaiserslautern), Thomas Zdebel (Bayer Leverkusen)
Borussia Mönchengladbach
* Zugänge: Tomas Galasek (Banik Ostrau), Paul Stalteri (Tottenham Hotspur), Christian Dorda (eigene Jugend), Logan Bailly (KRC Genk), Dante Bonfim (Standard Lüttich)
* Abgänge: Sebastian Svärd (ausgeliehenan Hansa Rostock), Sascha Rösler (1860 München)