Insgesamt 202 Neuzugänge, also im Schnitt etwas mehr als zehn pro Verein, wurden während der Sommerpause verpflichtet. Im Gegenzug verließen 236 Spieler die Vereine der neuen 3. Liga. Keine Überraschung: Besonders groß war die Fluktuation bei den vier Zweitliga-Absteigern. Zum aktuellen Kader des FC Erzgebirge Aue gehören allein 20 Neuzugänge – der höchste Wert der Liga. Dem SC Paderborn 07 kehrten nicht weniger als 23 Fußballer den Rücken, während 17 neue Spieler unter Vertrag genommen wurden.
Zu- und Abgänge in der 3. Liga vor der Saison 2008/2009:
VfR Aalen
Zugänge: Andersen (Borussia Mönchengladbach II), Bader (FC Luzern/Schweiz), Hohn (VfB Stuttgart, A-Jugend), Reus (FC St. Pauli), Schöckel (SV Wehen Wiesbaden), Shynder (SpVgg Greuther Fürth II), Teinert (SV Wacker Burghausen), D. Wagner (SV Selingenporten)
Abgänge: Cescutti (Karriere beendet), Donato, Ewertz, Fall, F. Fischer, Kurt (alle Ziel unbekannt), Joppe (SSVg. Velbert), Schiele (eigene zweite Mannschaft), Steegmann (SpVgg Unterhaching)
FC Erzgebirge Aue
Zugänge: Baltes (Rot-Weiss Essen), Bayrak (KSV Hessen Kassel), Cimen (Kickers Offenbach), Dojahn (FC Hansa Rostock II), El Berkani (Sportfreunde Siegen), Flauder, Georgi, Le Beau, Liebold, Lobsch, M. Müller, Rupf (alle eigene zweite Mannschaft), Feick, Hensel, Hochscheidt, Männel (alle FC Energie Cottbus II), S. Müller (VfB Lübeck), Paulus (1. FC Nürnberg), K. Schmidt (SV Werder Bremen II), Werling (Sakaryaspor/Türkei)
Abgänge: Bobel, Kaufman, Strbac, Pavlovic (alle Ziel unbekannt), Emmerich, Liebers (beide Chemnitzer FC), Feldhahn (SV Werder Bremen II), Geißler, Sykora, Trehkopf (alle VfL Osnabrück), Heller (FSV Mainz 05), Hampf, Loose (beide Rot-Weiß Erfurt), Keller (SG Dynamo Dresden), Klinka (SK Kladno/Tschechien), Kurth (FC Energie Cottbus), Leandro (SV Sandhausen), Nemec (MSK Zilina/Slowakei), Orahovac (SV Wehen Wiesbaden), Petrous (FC Slovan Liberec/Tschechien), Sträßer (FC Carl Zeiss Jena)
1. FC Union Berlin
Zugänge: Bastürk (DSC Wanne-Eickel), Busch (SV Babelsberg 03), Dogan (Wuppertaler SV Borussia), Griebsch (Germania Schöneiche), Hollwitz, Jahn (beide eigene A-Jugend), Kohlmann (Rot-Weiß Erfurt), Maek (VfL Wolfsburg II)
Abgänge: Hinz (Rot-Weiß Erfurt), Löring, Spasskov, Spork, Streit, (alle Ziel unbekannt), Martins, Ruttke, Scharlau (alle Germania Schöneiche)
Eintracht Braunschweig
Zugänge: Banser (Germania Halberstadt), Morabit (Sportfreunde Köllerbach), O‘Neill (SV Wilhelmshaven), Onuegbu (SC Idar-Oberstein), Schanda (VfL Osnabrück), Scheil, Yilmaz (beide eigene A-Jugend)
Abgänge: Bröcker (Ziel unbekannt), Hauk, Horacek, Peters (alle eigene zweite Mannschaft), L. Fuchs (VfL Osnabrück), Kumbela (SC Paderborn 07), Oehrl (SV Werder Bremen II), Ristic (SV Sandhausen), Schembri (FC Carl Zeiss Jena)
SV Werder Bremen II
Zugänge: Andersen (Rot-Weiss Essen), Bargfrede, Diekmeier, Dreyer, Granskov-Hansen, Gerdes, Kempe, Mielitz, Perthel, Ronneburg, Schiller (alle eigene A-Jugend), Feldhahn (FC Erzgebirge Aue), Oehrl (Eintracht Braunschweig), Testroet (FC Schalke 04, A-Jugend)
Abgänge: Banecki (FC Oberneuland), Bärje, Fickentscher, Lohmeier (alle Ziel unbekannt), Bischoff (Arsenal London/England), Johrden (TuS 1906 Heeslingen), Jürgen (Karriere beendet), Löning, Mohr (beide SC Paderborn 07), Mandic (Altona 93), Peitz (VfL Osnabrück), K. Schmidt (FC Erzgebirge Aue)
SV Wacker Burghausen
Zugänge: Böcher (FSV Ludwigshafen-Oggersheim), Calamita (SC Pfullendorf), Chokchev (USK Anif/Österreich), Kupfer (FC Hansa Rostock, A-Jugend), Lovric (eigene A-Jugend)
Abgänge: Dausel (Rot-Weiß Erfurt), Doll (FC Ingolstadt 04 II), Kudic, Jovanovic, Palionis, Volkov (alle Ziel unbekannt), Manske (SV Sandhausen), Niederquell, Rainer (beide eigene zweite Mannschaft), Rosin (1. FC Magdeburg), Teinert (VfR Aalen)
SG Dynamo Dresden
Zugänge: Grembowietz (FC Schalke 04 II), Keller (FC Erzgebirge Aue), Kirsten (SV Waldhof Mannheim), Müller (Sportfreunde Siegen), Petrovic (FK Zemun/Serbien) Röttger (SC Paderborn 07), Savran (Tennis Borussia Berlin), Schmidt (FV Dresden 06 Laubegast)
Abgänge: Bendovskyi, Herber, David, Person, Votava (alle Ziel unbekannt), Ernemann (SC Austria Lustenau/Österreich), Hauser (1. FC Gera 03), Helbig (FSV Zwickau), Penksa (Tatran Presov/Tschechien), Stocklasa (SV Ried/Österreich), Ulich (Karriere beendet/Scout bei Dynamo Dresden), Würll (SSV Jahn Regensburg), Zacher (SV Babelsberg 03)
Fortuna Düsseldorf
Zugänge: Kadah (VfB Lübeck), Sieger (Kickers Offenbach)
Abgänge: Anfang (Karriere beendet, Co-Trainer eigene zweite Mannschaft), Asaeda (Viktoria Aschaffenburg), Krecidlo (SC Paderborn 07), Pusic, Spier (beide Ziel unbekannt)
BSV Kickers Emden
Zugänge: Burmester, Hollander (beide eigene A-Jugend), Duffner (TURU Düsseldorf), El Hammouchi (Fortuna Sittard/Niederlande), Masuch (Rot-Weiss Essen), Nennhuber (Hammer SpVg.), Pfingsten, Unger (beide Sportfreunde Siegen), Ramaj (FC Energie Cottbus II), Sievers (VfB Lübeck)
Abgänge: Bork (Bonner SC), Cartus (Sportfreunde Siegen), Nachtigall (Bonner SC), Celikovic, Litjens, Reichwein (alle Wuppertaler SV Borussia), Grotlüschen (VfB Oldenburg), Krük (Eintracht Frankfurt), Neumann, Semghoun (beide VfB Lübeck), Rickert (TuS Koblenz), Tornieporth (KSV Hessen Kassel), Vujanovic (1. FC Magdeburg)
Rot-Weiß Erfurt
Zugänge: Cannizzaro (Hamburger SV II), Carolus, Montabell (beide Hannover 96 II), Dausel (SV Wacker Burghausen), Handke (eigene A-Jugend), Hinz (1. FC Union Berlin), Judt (Kickers Offenbach), Loose (FC Erzgebirge Aue), Möckel, Semmer (beide FC Sachsen Leipzig), Ströhl (eigene zweite Mannschaft)
Abgänge: Beck, Stark, Schubert (alle Hallescher FC), Brückner (Spvgg Greuther Fürth), Fondja, Laumann, Rrustemi (alle Ziel unbekannt), Heller (SSV Reutlingen), Holst (SC Paderborn 07), Kohlmann (1. FC Union Berlin), Maczkowiak (Rot-Weiss Essen)
FC Carl Zeiss Jena
Zugänge: Amirante, Bochud (beide FC Schaffhausen/Schweiz), Hähnge (FC Hansa Rostock), Kolitsch, A. Schmidt (beide eigene A-Jugend), Kikuchi (Jubilo Iwata/Japan), Nulle (SC Paderborn 07), T. Petersen (FC St. Pauli II), Reuther, Wuttke (beide eigene zweite Mannschaft), Schembri (Eintracht Braunschweig), R. Schmidt (1. FC Nürnberg), Sträßer (FC Erzgebirge Aue), Wallschläger (Hertha BSC Berlin II)
Abgänge: Allagui (SpVgg Greuther Fürth), Jensen (SC Paderborn 07), Kühne (Rot-Weiss Essen), Fröhlich, Oniani, Oswald, Schied, Seturidze, Stegmayer, Tapalovic (alle Ziel unbekannt), Günther (FSV Zwickau), Hoffmann (VFC Plauen), Kandelaki (SK Sturm Graz/Österreich), Khomutovski, Torghelle, Werner (alle FC Augsburg), Maul (SSV Jahn Regensburg), Omodiagbe (VfL Osnabrück), Saka (Hamburger SV II), Simak (VfB Stuttgart)
FC Bayern München II
Zugänge: Badstuber, Bopp, Ekici, Kopplin, T. Müller, Rohracker, Schürf (alle eigene A-Jugend), Duhnke (TSV 1860 München II), Riedmüller (SV Heimstetten), Stierle (Stuttgarter Kickers II)
Abgänge: Celozzi (Karlsruher SC), Görlitz (Ziel unbekannt), Kokocinski (Kickers Offenbach), Linke (Karriere beendet/Sportdirektor bei Red Bull Salzburg/Österreich), M. Schwarz (FC Ingolstadt 04), Wagner (MSV Duisburg)
Kickers Offenbach
Zugänge: Albayrak, Brighache (beide eigene zweite Mannschaft), Banouas (1. FC Kaiserslautern II), Becker (FC Augsburg), Damm (SV Wehen-Wiesbaden II), Goldschmidt, Rode (beide eigene A-Jugend), Haas (1899 Hoffenheim), Heitmeier (SV Wilhelmshaven), Huber (Hamburger SV II), Kokocinski (FC Bayern München II), Malura (Wuppertaler SV Borussia), Mesic, Schutzbach (beide SC Freiburg), Tosunoglu (MSV Duisburg II), Wulnikowski (Sportfreunde Siegen), Zinnow (SV 07 Elversberg)
Abgänge: Agritis, Epstein (beide Iraklis Thessaloniki/Griechenland), Bancé, Bungert (beide FSV Mainz 05), Cimen (FC Erzgebirge Aue), Como, Karrer, Mokhtari, Ogungbure, Pinske, Reich, Sichone, Toppmöller (alle Ziel unbekannt), Dundee (Karriere beendet), Hornig (1. FC Kaiserslautern II), Judt (Rot-Weiß Erfurt), C. Müller (FC Augsburg), Sieger (Fortuna Düsseldorf), Sousa (SC Beira-Mar/Portugal), Thier (Karriere beendet/Torwart-Trainer 1899 Hoffenheim), Wörle (SpVgg Greuther Fürth), Türker (SC Freiburg)
SC Paderborn 07
Zugänge: Alushi (SV Wehen Wiesbaden), Burchert (Hertha BSC Berlin II), Brandy, Guie-Mien, Güvenisik (alle Rot-Weiss Essen), Halfar (Hannover 96), Holst (FC Rot-Weiß Erfurt), Jensen (FC Carl Zeiss Jena), Krecidlo (Fortuna Düsseldorf), Kumbela (Eintracht Braunschweig), Löning, Mohr (beide SV Werder Bremen II), Lindemann (1. FC Magdeburg), Reinsch (FC Schalke 04, A-Jugend), Schuppan, Wachsmuth (beide FC Energie Cottbus II), Wemmer (VfL Wolfsburg II)
Abgänge: Bogavac, Boskovic, Djurisic, Krupnikovic, Lintjens, Noll (alle Ziel unbekannt), De Graef (Lierse SK/Belgien), Djebi-Zadi (Inverness Caledonian Thistle/Schottland), Döring (Rot Weiss Ahlen), Fall (FC Schaffhausen/Schweiz), Gouiffe á Goufan (FC St. Pauli), Hoilett (FC St. Pauli), Kläsener (FC Augsburg), Koen (SV Wehen Wiesbaden), Kruse (Borussia Dortmund), Löbe, Maaß (beide Karriere beendet), R. Müller (Kickers Offenbach), Nulle (FC Carl Zeiss Jena), Pisot (VfB Stuttgart II), Röttger (SG Dynamo Dresden), Schüßler (Rot-Weiß Oberhausen), Sinkala (FC Augsburg)
SSV Jahn Regensburg
Zugänge: Becker (SV Darmstadt 98), Blessin (Sportfreunde Siegen), Maul (FC Carl Zeiss Jena), Würll (SG Dynamo Dresden)
Abgänge: Anuk (Antalyaspor/Türkei), Kart (Kasimpasaspor Istanbul/Türkei), Lengsfeld (VfL Bochum), Mies (TSV Aindling), Zani (DJK Vilzing)
SV Sandhausen
Zugänge: Bindnagel (1899 Hoffenheim), Fießer (KSV Hessen Kassel), Leandro Grech (FC Erzgebirge Aue), Gurski (TuS Koblenz), Haas (SSV Reutlingen), Maas (VfB Stuttgart, A-Jugend), Manske (SV Wacker Burghausen), Öztürk (VfL Wolfsburg II), Ristic (Eintracht Braunschweig), Staniczek (SV Darmstadt 98), Throm (Sportfreunde Siegen)
Abgänge: Akwuegbu (SV 07 Elversberg), Altin (Antalyaspor/Türkei), Anane, Bauer, Fickert, Hickel, Petry (alle Ziel unbekannt), B. Barg (Wuppertaler SV Borussia), Essig (1. FC Heidenheim), Petkovic (FSV Frankfurt), Ruf (Bahlinger SC)
Stuttgarter Kickers
Zugänge: Huber (FC Ingolstadt 04), Janic, Schmiedel (beide SSV Reutlingen), Landeka (FSV Mainz 05 II), Kettemann (Spvgg Greuther Fürth) Reiß (FSV Ludwigshafen-Oggersheim), Schürg (SSV Ulm 1846), Traut (TuS Koblenz)
Abgänge: Akcay, Benda, Cerci, Yildiz (alle Ziel unbekannt), Baradell, Sökler (beide SSV Reutlingen), Lais (TSV 1860 München II), Parmak, Yelldell (beide TuS Koblenz), Steinle (eigene zweite Mannschaft), Stierle (FC Bayern München II), Wildersinn (FC Nöttingen)
VfB Stuttgart II
Zugänge: Enderle, Ismaili, Schimmel, Schmid, Schieber (alle eigene A-Jugend), Walch (Red Bull Salzburg/Österreich)
Abgänge: Dangelmayr (Karriere beendet), Lehmann, P. Mayer (beide Eintracht Frankfurt), Perchtold (1. FC Nürnberg), Sauter (SSV Ulm 1846)
SpVgg Unterhaching
Zugänge: Berchtold (SpVgg Bayreuth), Bischoff (SSV Reutlingen), A. Fink (TSV 1860 München II), Pasicil, Ziegler (beide eigene A-Jugend), Steegmann (VfR Aalen), Susak (Adelaide United FC/Australien)
Abgänge: Aydemir, Custos, Löppert (alle Ziel unbekannt), Gülselam (Trabzonspor/Türkei), Kolomaznik (Dukla Prag/Tschechien), Mario Konrad (SC Rheindorf Altach/Österreich), Lechleiter (FC Hansa Rostock), Riederer (1. FC Kaiserslautern II)
Wuppertaler SV Borussia
Zugänge: Altin, Oppermann (beide VfB Lübeck/waren ausgeliehen), Barg (SV Sandhausen), Celikovic, Litjens, Reichwein (alle Kickers Emden), Mahrt (FC St. Pauli, A-Jugend), Markolf (FSV Mainz 05), Schäfer (Rot-Weiss Essen), Uelker, Zaskoku (beide eigene zweite Mannschaft), Weikl (Sportfreunde Siegen), Willers (KSV Hessen Kassel)
Abgänge: Bölstler (Rot Weiss Ahlen), Dogan (1. FC Union Berlin), Habl (Germania Dattenfeld), Hähner, Kreil (beide KFC Uerdingen 05), Kohlhaas (SSVg. Velbert), Malura (Kickers Offenbach), Monbongo, Völzow (beide Ziel unbekannt), Rivera Cerezo (SV 07 Elversberg), Saglik (VfL Wolfsburg), Wiwerink (Bonner SC)